座標：34°30′8.5788″N 135°48′27.1368″E / 34.502383000°N 135.807538000°E / 34.502383000; 135.807538000藤原京，飛鳥京的西北部，位於今奈良縣橿原市，是日本史上最初最大的都城。而且還是日本史上最初的按照條坊制（じょうぼうせい）布局的中國式都城，這座都城還體現了《周禮》所傳達的思想。690年（持統4年）開工建設、694年（持統8年）從飛鳥浄御原宮遷都於此。據說都城建成於遷都後的第10年704年（景雲元年），而在676年（天武5年）就已經開工建設了。對於遷都的時間、一種說法是持統天皇在十二月初六（格里曆12月27日）的上午從飛鳥浄御原宮出發開始遷走。「藤原京」這個名字是近代所使用的學術用語，《日本書紀》裡面並沒有記載。《日本書紀》中關於都城的記載中，京指「新益京」（持統天皇六年正月十二日條）；宮指「藤原宮」。大和三山（耳成山、畝傍山、天香具山）所包圍的區域。藤原京在九州王朝的假說中，即大宰府。奈良県橿原市高殿町殘留有藤原宮大極殿（だいごくでん）的土台、周圍還存有古蹟公園。藤原宮跡的6成被指定為日本國家特別歷史遺蹟，藤原宮及其遺蹟的發掘調查工作仍在繼續。2007年1月、日本政府將飛鳥藤原宮都相關建築群登錄入世界遺產申請的暫定名單中。