「錦衣衛」人人聞之色變的恐怖特務機構！明太祖朱元璋為行高壓統治，精挑禁衛軍內身懷絕技、忠心不二的高手所組成，以冤獄、暗殺等泯滅人性手段，寫下歷史最黑暗的一頁。明朝末年，閹黨弄權亂政，「錦衣衛」被當朝司禮太監賈精忠所掌控。賈精忠密謀造反，私通藩王。錦衣衛四大護法之首青龍（甄子丹 飾）奉師命盜取勤王兵符卻遭閹黨構陷，曾經令人聞風喪膽的錦衣衛頭目，如今竟成同門追殺的目標。千鈞一髮之際，青龍幸獲馭天鏢局總鏢頭喬永之女喬花（趙薇 飾）相助，攜手亡命江湖。

兩人一路遭遇錦衣衛和各路江湖高手。正當青龍逐漸查清賈精忠圖謀造反之陰謀真相之際，行蹤卻被錦衣衛佈下的天羅地網所掌握，並派出神鬼莫測的淨衣派頭號女殺手脫脫（徐子珊 飾）追殺，青龍在重重諜網，腹背受敵下，幸被人稱大漠判官的江湖第一大幫主（吳尊 飾），被青龍懲奸除惡的義行感動，決定拔刀相助。一場最後的正邪決戰，即將展開。